Ситуиран на втория етаж. Състоящ се от 12 операционни зали, разпределени между всички хирургични отделения. Първа клиника разполага с две операционни зали 6-а и 7-ма зала. Първа клиника по хирургия изпълнява своята оперативна дейност по здравна каса от понеделник до петък. Оперативно отделение разполага с цялата необходима апаратура и консумативи за извършване на цялата палитра от планови и спешни операции в коремната хирургия.